Povećanje biološkog mikroskopa obično je malo, u rasponu od 40x do 1000x. To je zato što su biološki uzorci obično prozirni i zahtijevaju umjereno povećanje za promatranje strukture stanica i tkiva.
U biološkom mikroskopu povećanje je određeno kombinacijom leće objektiva i okulara. Uobičajena povećanja objektiva uključuju 4x, 10x, 40x i 100x, dok okular obično ima povećanje od 10x. Stoga je maksimalno povećanje tipičnog biološkog mikroskopa 100x objektiva pomnoženo s 10x okulara, što je jednako 1000x.
Važno je napomenuti da povećanje biološkog mikroskopa nije toliko veliko kao kod elektronskog mikroskopa jer su biološki uzorci često složene strukture, a proces promatranja zahtijeva održavanje održivosti i cjelovitosti uzoraka. Osim toga, razlučivost biološkog mikroskopa također je ključna jer su biološke strukture često vrlo male i zahtijevaju visoku razlučivost za promatranje sitnih detalja.
U određenim specijaliziranim primjenama koje zahtijevaju veće povećanje, kao što su patološka istraživanja ili mikrokirurgija, okular s većim povećanjem (npr. 16x ili više) može se koristiti u kombinaciji s odgovarajućim okularima za postizanje većeg povećanja. Međutim, ova promatranja s velikim povećanjem obično zahtijevaju složeniju pripremu uzoraka i tehnike mikroskopije te zahtijevaju veću vještinu operatera.